Meilleur logiciel pour clinique vétérinaire 2026 : les six solutions comparées

Un logiciel pour clinique vétérinaire réunit le dossier de chaque animal et de son propriétaire, l'agenda, les ordonnances, la pharmacie et les stocks, la facturation et les rappels de vaccins. Les plus complets ajoutent la liaison avec les centrales d'achat, la transmission des cessions d'antibiotiques à CalypsoVet, la prise de rendez-vous en ligne, une application pour les visites en élevage et la gestion de plusieurs sites.

En France, le marché reste dominé par des éditeurs nationaux, dont plusieurs sont liés aux centrales qui approvisionnent les cliniques. Une clinique canine urbaine, une pratique rurale qui tourne dans les élevages et un vétérinaire équin seul n'attendent pas les mêmes fonctions. Cette page compare six logiciels conçus pour l'exercice en France. Pour la tenue des comptes de la clinique, notre comparatif des logiciels de comptabilité pour PME complète cette sélection.

Ce que nous avons relevé

Notre grille d'évaluation

Les notes de cette page sont une appréciation éditoriale. Nous n'avons déployé aucun de ces logiciels dans une clinique et nous n'avons pas interrogé de vétérinaires. Chaque logiciel a été jugé sur sept critères, à partir des informations publiées par les éditeurs et des textes officiels.

1. Dossier et ordonnance : fiche animal et propriétaire, ordonnances conformes, numéros de lot.
2. Pharmacie et stocks : registre des délivrances, lots et péremptions, commandes aux centrales.
3. Obligations déclaratives : CalypsoVet, identification I-CAD et SIRE, facture électronique.
4. Relation client : rappels par SMS, prise de rendez-vous en ligne.
5. Pratiques couvertes : canine, rurale, équine, NAC, plusieurs sites.
6. Données : fonctionnement en ligne ou installé, hébergement, sauvegardes.
7. Coût : tarif publié, options, engagement, frais de mise en service.

Le classement des six logiciels

1. GmVet : 8,7

GmVet est édité par G.M.V., une société de Taden, dans les Côtes-d'Armor, filiale technique de la coopérative Centravet. Ce logiciel fonctionne entièrement en ligne, sans installation, avec des serveurs en France. Il couvre le dossier médical, la pharmacie et les stocks, la gestion de plusieurs sites, les rappels par SMS, la prise de rendez-vous en ligne et un module rural offert.

Points forts

• Un logiciel en ligne hébergé en France.
• Le module rural et la liaison avec les centrales inclus sans supplément.
• Une facture électronique déjà reliée à la plateforme agréée Seqino.
• Des assistants vétérinaires ajoutés sans frais.

Points faibles

• Une assistance facturée 39 € HT par mois et par site hors engagement coopératif.
• Une reprise de données de 650 à 1 090 € HT.
• Aucun essai gratuit, seulement une démonstration.

Tarifs. Selon la grille tarifaire 2026, l'abonnement coûte 64 € HT par mois pour un vétérinaire, un ASV et un site. Chaque vétérinaire supplémentaire ajoute 28 € HT et chaque site 25 € HT. Les SMS coûtent 0,08 € et chaque facture électronique 0,09 €.

Pour qui ? GmVet convient aux cliniques canines et mixtes qui veulent un logiciel en ligne complet, en particulier celles qui adhèrent déjà à Centravet.

2. Vetup : 8,4

Vetup est édité par une société marseillaise qui emploie entre 20 et 49 salariés et revendique des utilisateurs dans seize pays. Ce logiciel en ligne réunit le dossier médical, les ordonnances avec numéros de lot, les stocks, les rappels et SMS, l'agenda et la liaison avec les centrales Alcyon, Centravet et CDMV, avec des données traitées en France ou dans l'Union européenne.

Points forts

• Le ticket d'entrée le plus bas de la sélection.
• Une liaison avec les trois grandes centrales d'achat.
• Une offre MAX qui inclut la gestion de plusieurs cliniques.
• Un essai gratuit immédiat.

Points faibles

• Une offre Basic limitée à 100 consultations par mois.
• Un engagement d'un an reconduit tacitement.
• Un passage automatique en Premium quand les limites de Basic sont dépassées.
• Une facture électronique vendue en option.

Tarifs. Selon la grille publiée par Vetup, l'offre Basic coûte 29 € HT par mois pour un vétérinaire et un ASV, Premium 69 € HT et MAX 129 € HT. Un vétérinaire supplémentaire coûte 39 € HT par mois, un ASV 9 € et la facture électronique 10 €.

Pour qui ? Vetup convient aux vétérinaires qui s'installent et aux petites cliniques qui veulent un logiciel en ligne à prix modéré.

3. Epivet : 8,0

Epivet est édité par une société de Blagnac, en Haute-Garonne, qui se présente comme indépendante de tout laboratoire et de toute centrale. Ce logiciel Windows conserve les données sur l'ordinateur ou le serveur de la clinique. Il gère les stocks par numéro de lot avec suivi des périmés, les ordonnances, la transmission à CalypsoVet et à l'IFCE et les rappels par SMS.

Points forts

• Un prix selon l'activité, canine, rurale ou équine.
• Un abonnement mensuel sans engagement, ou une licence définitive.
• Un stock suivi par numéro de lot, avec les dates de péremption.
• Un connecteur vers la plateforme agréée SuperPDP pour la facture électronique.

Points faibles

• Aucune version en ligne : les sauvegardes reviennent à la clinique.
• Une version mobile facturée 20 € par mois en plus.
• Plusieurs sites gérés par synchronisation des bases locales.

Tarifs. Selon la page de tarifs, l'abonnement coûte 45 € HT par mois en canine, 70 € HT en rurale et 90 € HT en équine, plus 25, 40 ou 50 € par vétérinaire supplémentaire. Chaque site supplémentaire coûte 20 €.

Pour qui ? Epivet convient aux pratiques rurales et équines qui veulent un prix adapté à leur activité et gardent leurs données sur place.

4. dr.veto : 7,6

dr.veto est édité par Hubvet, une société présidée par Alcyon France, la centrale d'achat vétérinaire. Le logiciel existe en version Windows et en version en ligne, avec un mode déconnecté. Il couvre la canine, la rurale, l'équine et les NAC, les ordonnances, les stocks, les SMS et la liaison avec les centrales Alcyon, Centravet et Coveto.

Points forts

• Le choix entre logiciel installé et logiciel en ligne.
• Toutes les pratiques couvertes, NAC compris.
• Un mode déconnecté utile en visite.
• Une liaison avec les trois grandes centrales, malgré l'appartenance à Alcyon.

Points faibles

• Une installation facturée 325 € HT, formation comprise.
• Aucune solution de facture électronique annoncée.
• Un lien avec Alcyon que le site ne mentionne pas.

Tarifs. Selon la page de tarifs, la version Windows coûte 65 € HT par mois et la version en ligne 86,50 € HT pour un vétérinaire et un site, puis 21,50 € HT par vétérinaire supplémentaire jusqu'à dix. La reprise de données coûte 400 ou 550 € HT.

Pour qui ? dr.veto convient aux cliniques qui veulent garder le choix entre un logiciel installé et un logiciel en ligne.

5. Vétocom : 7,4

Vétocom est édité par Digivet, une société lyonnaise du groupe Santévet, et revendique entre 1 400 et 1 700 structures selon les pages de son site. Ce logiciel installé gère plusieurs sites, les ordonnances, les stocks, les fichiers tarifs de toutes les centrales, les rappels par SMS et les rendez-vous en ligne, avec les applications mobiles mVet et Ruralvet.

Points forts

• Une gestion de plusieurs sites éprouvée.
• Des applications mobiles pour les visites, dont une dédiée à la rurale.
• La traçabilité des lots en rurale.
• Une facture électronique reliée à la plateforme agréée Seqino.

Points faibles

• Un logiciel installé, avec l'accès en ligne en option.
• Un prix de départ publié sans précision hors taxes ou toutes taxes.
• Une grille détaillée absente du site.

Tarifs. Le site de Vétocom annonce un abonnement à partir de 52 € par mois. La réception des factures électroniques coûte 5 € HT par mois et chaque émission 0,09 € HT.

Pour qui ? Vétocom convient aux structures multisites et rurales attachées à un logiciel installé.

6. Vet'Phi : 5,9

Vet'Phi est édité par Log'Phi Assistance, une société indépendante de Tournefeuille, en Haute-Garonne, qui revendique plus de 1 700 postes équipés. Ce logiciel Windows, monoposte ou en réseau, garde toutes les données dans la clinique. Il gère les ordonnances, l'archivage des lots, CalypsoVet, les stocks avec toutes les centrales et les SMS.

Points forts

• Une licence achetée une fois, sans abonnement mensuel.
• Des données qui restent dans la clinique.
• Des SMS à 0,059 € HT.
• Un essai libre et gratuit.

Points faibles

• Aucune version en ligne ni application mobile.
• Une certification de caisse NF525 encore en cours.
• Aucune solution de facture électronique annoncée.
• Un contrat de maintenance reconduit tacitement, à résilier avant le 31 octobre.

Tarifs. Selon la page de Vet'Phi, la licence monoposte coûte 909 €, plus 273,20 € HT par an de maintenance, et la licence pour trois postes en réseau 1 878 €, plus 412,80 € HT par an. L'assistance est gratuite pendant 90 jours.

Pour qui ? Vet'Phi convient aux vétérinaires seuls qui préfèrent acheter une licence et garder leurs données sur leur ordinateur.

Ce que la réglementation impose

1. Le registre des délivrances de médicaments se tient sans blanc ni rature, sur papier ou sur un système informatique non modifiable doublé d'une copie de secours, et se conserve dix ans selon l'article R5141-112 du code de la santé publique. Il doit pouvoir être édité immédiatement à la demande d'un contrôleur.
2. L'ordonnance porte les mentions fixées par l'article R5141-111 du même code : identité et numéro d'Ordre du vétérinaire, détenteur, identification des animaux, médicament, posologie, quantité, durée, voie d'administration et temps d'attente pour les animaux destinés à la consommation. Le vétérinaire conserve cinq ans un exemplaire des ordonnances d'aliments médicamenteux.
3. Les antibiotiques d'importance critique sont interdits en préventif. En curatif, ils exigent un examen clinique, l'identification de la bactérie et un antibiogramme, pour une prescription d'un mois au plus ; les résultats d'analyse se conservent cinq ans.
4. Chaque cession d'antibiotique se déclare au ministère de l'Agriculture avant la fin du mois qui suit, selon l'article R5141-150. Depuis avril 2023, un logiciel qualifié transmet ces données à CalypsoVet après accord du vétérinaire ; sinon, la saisie se fait à la main.
5. L'identification est obligatoire pour les chiens de plus de quatre mois et les chats de plus de sept mois, avec inscription au fichier I-CAD. Pour les équidés, le vétérinaire transmet l'identification à la base SIRE de l'IFCE dans les huit jours.
6. La télémédecine vétérinaire n'a plus de base réglementaire depuis la fin de l'expérimentation, en novembre 2021. L'Ordre a indiqué qu'il n'agirait pas contre les vétérinaires qui respectent l'ancien cadre : un animal vu dans les douze derniers mois, une déclaration au conseil régional de l'Ordre et aucun antibiotique critique prescrit à distance.
7. La TVA s'applique au taux de 20 % sur les soins vétérinaires comme sur les médicaments à usage vétérinaire : la France n'a pas transposé le taux réduit autorisé par le droit européen.
8. Le logiciel de caisse qui enregistre les ventes aux particuliers doit disposer d'un certificat ou d'une attestation de l'éditeur. À défaut, l'amende atteint 7 500 € par logiciel.
9. La facturation électronique s'impose en réception à toutes les entreprises depuis le 1er septembre 2026. Les cliniques de taille PME devront émettre des factures électroniques pour leurs clients professionnels, comme les éleveurs, et transmettre les données de leurs ventes aux particuliers à partir du 1er septembre 2027.

Comment choisir selon votre pratique

Une clinique canine

Les rappels de vaccins, la prise de rendez-vous en ligne et la pharmacie pèsent le plus. GmVet et Vetup couvrent ce besoin en ligne ; Vetup coûte moins cher tant que la clinique reste sous 100 consultations par mois. Pour l'agenda en ligne, notre comparatif des logiciels de prise de rendez-vous présente d'autres approches.

Une pratique rurale ou mixte

Les visites en élevage, les ordonnances avec temps d'attente et la déclaration des antibiotiques deviennent décisives. Epivet tarife la rurale à 70 € HT par mois, GmVet offre son module rural et Vétocom propose l'application Ruralvet pour le terrain.

Une pratique équine

Epivet est le seul à proposer une offre équine dédiée, à 90 € HT par mois, avec la transmission à l'IFCE. dr.veto couvre aussi l'équine, avec un mode déconnecté utile dans les écuries.

Une structure de plusieurs sites

GmVet facture 25 € HT par site supplémentaire, Vetup inclut la multiclinique dans son offre MAX et Vétocom revendique une longue pratique des groupes. Vérifiez que les stocks et les dossiers sont partagés entre les sites.

Un vétérinaire seul

Vetup Basic à 29 € HT par mois et Vet'Phi en licence monoposte limitent la dépense. Le premier évite toute sauvegarde à gérer ; le second évite tout abonnement.

Les cinq erreurs à éviter

1. Oublier les frais annexes. Assistance, reprise de données, installation, SMS et vétérinaires supplémentaires peuvent doubler le prix d'appel.
2. Négliger la reprise des données. Demandez un essai d'import sur vos propres dossiers avant de signer, et un export complet en fin de contrat.
3. Gérer seul les sauvegardes d'un logiciel installé. Le registre des délivrances se garde dix ans : prévoyez une copie de secours hors de la clinique.
4. Saisir CalypsoVet à la main. Un logiciel qualifié transmet les cessions d'antibiotiques chaque mois sans ressaisie.
5. Repousser la facture électronique. Vérifiez dès maintenant que le logiciel est relié à une plateforme agréée avant l'échéance de septembre 2027.

FAQ : logiciel pour clinique vétérinaire

Quel est le meilleur logiciel pour clinique vétérinaire en 2026 ? GmVet arrive en tête de ce comparatif avec 8,7 : ce logiciel en ligne, hébergé en France et filiale de Centravet, couvre toutes les pratiques à partir de 64 € HT par mois. Vetup (8,4) et Epivet (8,0) complètent le podium.

Combien coûte un logiciel vétérinaire ? Les abonnements démarrent à 29 € HT par mois chez Vetup, 45 € HT chez Epivet, 52 € chez Vétocom, 64 € HT chez GmVet et 65 € HT chez dr.veto. Vet'Phi se vend en licence à 909 €, plus 273,20 € HT de maintenance par an.

Faut-il un logiciel en ligne ou installé ? Un logiciel en ligne, comme GmVet ou Vetup, confie l'hébergement et les sauvegardes à l'éditeur. Un logiciel installé, comme Epivet ou Vet'Phi, garde les données dans la clinique, qui doit alors assurer elle-même leur sauvegarde pendant dix ans.

Combien de temps conserver le registre des médicaments ? Le registre des délivrances de médicaments vétérinaires se conserve dix ans, selon l'article R5141-112 du code de la santé publique. Tenu par informatique, il doit être non modifiable et doublé d'une copie de secours.

Comment déclarer les ventes d'antibiotiques ? Chaque cession de médicament contenant un antibiotique se déclare au ministère de l'Agriculture avant la fin du mois suivant. Les logiciels qualifiés transmettent ces données à CalypsoVet après accord du vétérinaire.

La téléconsultation vétérinaire est-elle autorisée ? La télémédecine vétérinaire n'a plus de base réglementaire depuis novembre 2021. L'Ordre tolère la pratique dans le cadre de l'ancienne expérimentation, pour un animal vu dans les douze derniers mois et sans prescription d'antibiotique critique.

Quelle TVA s'applique aux actes vétérinaires ? Les soins vétérinaires et les médicaments à usage vétérinaire sont soumis au taux normal de 20 %. Aucun taux réduit n'a été transposé en droit français.

Quel logiciel vétérinaire pour une pratique rurale ? Epivet propose une offre rurale à 70 € HT par mois, GmVet inclut son module rural sans supplément et Vétocom dispose de l'application Ruralvet pour les visites en élevage.